Shopifyの顧客管理画面のメタフィールドから直接ランク名を編集してもいいでしょうか？

いいえ、顧客のメタフィールドを直接書き換えた場合、アプリ側のデータと異なる状態になってしまうため、ランクが格納されているメタフィールドの直接の編集はしないでください。

編集を行った場合でも、次の評価（例えば顧客が商品を購入した場合や定期実行、手動実行など）のタイミングでアプリに設定済みのランク名に変更になります。

ランクの設定を変更し、一括で全ての顧客のランクを変更したい場合はアプリの「基本設定 > 高度な操作 > 手動で全てのランク評価を実行する」から手動でデータの更新を行なってください。（画面に表示される注意事項を必ずご確認ください） ※手動一括評価実行については、マニュアルをご参照ください。